Лягушье – урочище. Бывшая деревня бывшего Ячменюшенского сельсовета. Располагалась на левом берегу р. Томь, в устье притока Томи небольшой реки Лягушья (длина 16 км.) от которой и получила свое название.
Древние кочевые народы оставили свой след на территории поселка фрагментами грубой керамики, костями животных, углями, найденными в обрыве берега на берегу Томи экспедицией КГПИ в 1971 году.
Деревня Лягушье, возникла как заимка основанная пасечниками села Черный этап находящегося в 3-х километрах от Лягушьей, в начале 20-го века. Первое официальное упоминание о ней, доступное мне, отражено на карте Томской губернии за 1921 год. В 1926 году население деревни составляет 41 человек при 9-ти хозяйствах. Из них 20 жителей мужского пола, 21 – женского. Сама деревня, на тот момент, именуется «Нижней Лягушьей» (в те времена была еще и «Верхняя Лягушья»). По-видимому, в 30-х годах 20-го века основывается лесничество. Позже появляется леспромхоз. На высоком месте, у подножия горы строится средняя школа, и интернат в котором жили ученики из соседних деревень школ не имеющих.
В 60-х годах средняя школа закрывается, остается лишь начальная школа. В 1968 году Лягушье насчитывало 142 жителя при 25 хозяйствах. Постоянный отток населения из Лягушьей поставил деревню на грань закрытия. Однако в связи со строительством крапивинского водохранилища, и необходимости вырубки поймы реки Томь, в Лягушьей размещается колония – вольное поселение, что ведет к резкому росту деревни.
В конце 80-х годов, в связи с борьбой общественности против строительства водохранилища и с ухудшением экономической обстановки, программа строительства водохранилища была свернута, а сам недостроенный гидроузел законсервирован. Колония дислоцирующаяся в дер. Лягушье была расформирована. В настоящее время Лягушье прекратило свое существование.
Близ бывшей деревни находится вросший в берег остов парохода. Вопрос, что это за пароход, и как он здесь оказался, долгое время не давал покоя посещающим эти места. Похоже на первую часть вопроса исследователь Евгений Тамбовцев ответ нашел. Ему удалось установить, что это грузопассажирский пароход «Смелый», который принадлежал компании «Братья Колесниковы и Волгаръ». Еще в 1912 году данный пароход начал совершать еженедельные рейсы из Томска в Кузнецк. В 1919 году пароход был реквизирован у владельцев, а в конце 1940-х годов передан Колпашевскому порту. В 1952 году на Самусьской судоверфи был произведен очередной и последний ремонт парохода. А вот как он попал на Лягушье, и что с ним произошло, вопрос остается открытым.